Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc27Q3V036 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms