Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfi1Q3UZY0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfi1Q3UZY0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms