Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms