Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capn13Q3UW68 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn13Q3UW68 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn13Q3UW68 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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