Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms