Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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