Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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