Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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