Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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