Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Lrrc58Q3UGP9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Lrrc58Q3UGP9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Lrrc58Q3UGP9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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