Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms