Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
YrdcQ3U5F4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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