Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms