Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
InipQ3TXT3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms