Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms