Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms