Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

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Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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