Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ush2AQ2QI47 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms