Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms