Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam171bQ14CH0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms