Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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