Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q149G0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q149G0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms