Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd2Q0VET5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmntd2Q0VET5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms