Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms