Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms