Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms