Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms