Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms