Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms