Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms