Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms