Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms