Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr5Q04683 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms