Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnb1Q03717 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms