Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms