Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GscQ02591 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms