Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlh1Q02576 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlh1Q02576 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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