Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms