Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms