Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms