Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2aQ01320 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms