Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms