Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms