Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms