Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms