Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms