Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1bP97358 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1bP97358 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1bP97358 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1bP97358 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1bP97358 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1bP97358 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1bP97358 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1bP97358 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1bP97358 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1bP97358 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms