Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms