Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad50P70388 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms