Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms